Versions Compared

Old Version 7

changes.mady.by.user Kristijan Mrkalj

Saved on

compared with

New Version Current

changes.mady.by.user Kristijan Mrkalj

Saved on

Key

  • This line was added.
  • This line was removed.
  • Formatting was changed.

Table of Contents

Opis

XCrySDen ((X-Window) CRYstalline Structures and DENsities) je računalno-kemijska aplikacija za vizualizaciju kristala i molekula.

Osim uobičajenih tipova datoteka, može učitavati i datoteke (inpute) računalno-kemijskih aplikacija poput Quantum ESPRESSO, Gaussian, ORCA i dr.

Verzije

VerzijaModulPodrškaSupekPadobran
1.6.2scientific/xcrysden/1.6.2CPUcheck mark button check mark button(error) 

Službena dokumentacija

Napomene

Warning

XCrySDen je potrebno koristiti isključivo za vizualizaciju.


Warning

Kako bi se aplikacija uspješno pokrenula, potrebno je spojiti se na pristupni čvor uz prosljeđivanje X11.

U slučaju korištenja Linuxa ili macOS-a, koristite naredbu:

ssh -X -i ~/.ssh/id_rsa username@login-cpu.hpc.srce.hr

U slučaju korištenja Windowsa, potrebno je preuzeti aplikaciju Xming te je pokrenuti prije pokretanja PuTTY-ja.

Unutar PuTTY-ja, potrebno je uključiti X11 forwarding (Connection → SSH → X11, Enable X11 forwarding).


Primjer korištenja

Code Block
languagebash
themeMidnight
module load scientific/xcrysden/1.6.2


Code Block
languagebash
themeMidnight
xcrysden --pw_inp calcite.in