...
| Warning | ||
|---|---|---|
| ||
ORCA dolazi u obliku prekompajliranih izvršnih datoteka koje se povezuju na Open MPI knjižnice verzije 4.1.1, a koje trenutno nisu kompatibilne sa Supekovim interkonekcijskim sustavom, odnosno HPE Cray Slingshot mrežom.Iz tog razloga, ORCA-u je u trenutnoj iteraciji nužno koristiti unutar jednog radnog čvora, po uzoru na OpenMP aplikacije. |
Službena dokumentacija
- https://www.orcasoftware.de/tutorials_orca/#
- https://orcaforum.kofo.mpg.de/app.php/portal
- ORCA 5.0.4 priručnik
Primjeri
Za pravilno pokretanje aplikacije morate zatražiti jedan računalni čvor.
U primjeru niže, aplikacija će se pokrenuti sa 16 MPI procesa.
...
| Code Block | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| ||||||
#!/bin/bash #PBS -q cpu #PBS -l ncpusselect=16 #PBS -N orca cdMPI_NUM_PROCESSES=$(cat ${PBS_NODEFILE} | wc -l) cd ${PBS_O_WORKDIR} module load scientific/orca/5.0.4 # Prilagodi input datoteku za paralelno izvodjenje sed -i "2i %PAL NPROCS ${NCPUSMPI_NUM_PROCESSES} END" hydrolysis.inp # Poziv aplikacije ${ORCA_ROOT}/orca hydrolysis.inp # Resetiraj input datoteku sed -i "2d" hydrolysis.inp |
...