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| Code Block | ||||
|---|---|---|---|---|
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#!/bin/bash
#$ -N deepARG-predict
#$ -pe a16-mpifull 16
#$ -cwd
module load bioinfo/deepARG
deeparg predict --model LS -i ORFs.fa -o test/pred -d $DEEPARGDB --type nucl --min-prob 0.8 --arg-alignment-identity 30 --arg-alignment-evalue 1e-10 --arg-num-alignments-per-entry 1000 |
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