Versions Compared

Key

  • This line was added.
  • This line was removed.
  • Formatting was changed.

...

Moduli koji dopremaju g_mmpbsa u Vašu okolinu definirani su u tablici niže:

VerzijaModul
1.1.0
g_mmpbsa/1.1.0

Primjer korištenja

Warning

Počevši od verzije GROMACS-a 5.0, svi alati su moduli izvršne datoteke pod nazivom gmx:

  • gmx grompp ...
  • gmx mdrun ...

Budući da g_mmpbsa koristi stariju GROMACS-a, svaki se od alata poziva direktno, bez gmx-a:

  • grompp ...
  • mdrun ...


Code Block
languagebash
titlemmpbsa.sge
linenumberstrue
#!/bin/bash

#$ -N mmpbsa
#$ -cwd
#$ -pe *mpisingle 4

module load g_mmpbsa/1.1.0

export OMP_NUM_THREADS=${NSLOTS}

g_mmpbsa -f input.xtc -s input.tpr -n input.ndx -i input.mdp <arg>

...