Korištenje
Na klasteru su instalirani svi pomoćni moduli programskog paketa Q6 u serijskoj i paralelnoj izvedbi - Qcalc6 Qdum6 Qdyn6 Qfep6 Qpi6 Qprep6 Qpi6p Qdyn6p.http://xray.bmc.uu.se/~aqwww/q/
Dostupne verzije su:
| Verzija | Modul |
|---|
| 6.0. | 816 | Q6/6.0. | 8-intel16 |
| Code Block |
|---|
|
#$ -N q6-parallel
#$ -pe *mpi 14
#$ -q p28.q
#$ -cwd
# load program environment
module load Q6/6.0.16
# run the program
mpirun -np $NSLOTS Qdyn6p eq1.inp > eq1.log
|
...
Instalacija
Programski paket Q6 je pripremljen s kompajlerom Intel 2019 i MPI implementacijom OpenMPI 3.0.0. Instalacija je obavljena dopremanjem izvornog koda, učitavanjem potrebnih modula za kompajler i MPI te kompajliranjem samog paketa.
| Code Block |
|---|
| title | Dopremanje izvornog koda i kompajliranje |
|---|
|
git clone https://www.github.com/qusers/Q6.git
cd Q6/src/
|
Primjer korištenja
| Code Block |
|---|
module load Q6/6.0.8-intelmpi/openmpi3-intel-x86_64
make all COMP=ifort
make mpi COMP=ifort |