Versions Compared

Key

  • This line was added.
  • This line was removed.
  • Formatting was changed.

Image Added

Opis

Clustal Omega je program za višestruko poravnavanje sekvenci za poravnavanje tri ili više sekvenci zajedno na računalno učinkovit i točan način.

Proizvodi biološki značajna višestruka poravnanja sekvenci divergentnih sekvenci. Evolucijski odnosi mogu se vidjeti gledanjem kladograma ili filograma.


Verzije

VerzijaModulSupekPadobran
1.2.4scientific/clustalO/1.2.4(error) (tick)


Službena dokumentacija

...

Code Block
languagebash
titleAlign
linenumberstrue
#!/bin/bash
#PBS -N ClustalO-test
#PBS -l select=1:ncpus=40:mem=10GB

cd $PBS_O_WORKDIR

module load scientific/clustalO/1.2.4
 
clustalo -i bench/tms_test-only.vie -o tms_test-only.a2m -v --threads $NSLOTS$NCPUS


Warning
titleNapomena

Program Clustal Omega zadano uzima sve dostupne procesore, stoga je potrebno ograničit sa opcijom --thread pri korištenju.