Page History

...

ASTRAL pronalazi stablo vrsta koje ima najveći broj zajedničkih induciranih kvartet stabala sa skupom genskih stabala, podložno ograničenju da skup biparticija u stablu vrsta dolazi iz unaprijed definiranog skupa biparticija.

Verzije

Verzija	Modul	Supek	Padobran
5.7.8	scientific/Astral/5.7.8

Dokumentacija

• https://github.com/smirarab/ASTRAL/blob/master/astral-tutorial.md#running-astral

...

• Primjer je preuzet sa:
  • https://github.com/smirarab/ASTRAL/tree/master/main/test_data
• Aplikacija nema mogućnost širenja na više cpu-a

#!/bin/bash

#PBS -N Astral-test
#PBS -q cpu_180

cd $PBS_O_WORKDIR
module load scientific/Astral/5.7.8

astral.sh astral -i  1KP-genetrees-BS10.tre

...