...
Primjer podnošenja posla. Testni podaci su preuzeti iz https://bitbucket.org/nygcresearch/treemix/downloads/treemix_test_files.tar.gz
| Code Block | ||||
|---|---|---|---|---|
| ||||
#!/bin/sh |
...
#$ -N treemix-teran |
...
#$ -cwd |
...
# load program environment |
...
module load treemix/1.13 |
...
# run the program |
...
treemix -i testin.gz -o out_stem |
Preduvjet za instalaciju bliblioteke boost-devel =>1.42 i gsl-devel. Instalacija je izvršena sa prevoditeljem intel/2020.
Instalirano je lokalno, kasnije prebačeno u /apps/bioinfo.
| Code Block | ||||
|---|---|---|---|---|
| ||||
wget https://bitbucket.org/nygcresearch/treemix/downloads/treemix-1.13.tar.gz |
...
module load intel/2020 |
...
CC=icc CXX=icpc |
...
./configure --with-boost=/apps/boost/1.70/avx2/ |
...
make && make install |