...
| Code Block |
|---|
|
#$ -N gpaw-parallel
#$ -q p28.q
#$ -pe *mpi 14
#$ -cwd
module load GPAW/22.1.0
mpirun --mca btl_openib_allow_ib true -hostfile $TMPDIR/machines -np $NSLOTS gpaw python Ag3Au_test_srce.py |
| Tip |
|---|
|
Aplikacija je instalirana i konfigurirana u Python virtualnom okruženju kojeg korisnik može proširiti sa svojim proizvoljnim Python aplikacijama. Nakon učitavanja modula, korisnik dodatne aplikacije instalira s: | Code Block |
|---|
conda create --prefix $LOCALPKGS python=3.8
conda install --prefix $LOCALPKGS potrebni-python-pkg |
|
Instalacija
Programski paket GPAW je pripremljen s kompajlerom Intel 2019, Intel MKL Scalapack i MPI implementacijom OpenMPI 4.1 u Conda okruženju s Python 3.8. Instalacija je obavljena pripremom pomoćnih biblioteka na koje se paket oslanja, dopremanjem izvornog koda, učitavanjem potrebnih modula za kompajler i MPI paralelizaciju te izgradnjom Python wheel paketa koji se onda instalira u Conda okruženje.
...