...
| Code Block | ||
|---|---|---|
| ||
#$ -N alphafold2 #$ -pe gpu 1 #$ -l cores=5 #$ -cwd module load bioinfo/alphafold2/2.0.1 GPUDEVICE=$(cat $TMPDIR/gpu) run_alphafold.sh -d $ALPHAFOLDDB -o dummy_test -m model_1 -f example/query.fasta -t 2020-05-10 -a $GPUDEVICE -n 105 |
| Tip | ||
|---|---|---|
| ||
Aplikacija je instalirana i konfigurirana u Python virtualnom okruženju kojeg korisnik može proširiti sa svojim proizvoljnim Python aplikacijama. Nakon učitavanja modula, korisnik dodatne aplikacije instalira s:
|
...