...
Code Block | ||
---|---|---|
| ||
$ module load GPAW/22.1.0 $ gpaw info ------------------------------------------------------------------------------------------------------------- | python-3.8.12 /apps/virtenv/gpaw22.1.0/bin/python3.8 | | gpaw-22.1.0 /apps/virtenv/gpaw22.1.0/lib/python3.8/site-packages/gpaw/ | | ase-3.22.1 /apps/virtenv/gpaw22.1.0/lib/python3.8/site-packages/ase/ | | numpy-1.22.2 /apps/virtenv/gpaw22.1.0/lib/python3.8/site-packages/numpy/ | | scipy-1.8.0 /apps/virtenv/gpaw22.1.0/lib/python3.8/site-packages/scipy/ | | libxc-5.2.2 yes | | _gpaw /apps/virtenv/gpaw22.1.0/lib/python3.8/site-packages/_gpaw.cpython-38-x86_64-linux-gnu.so | | MPI enabled yes | | OpenMP enabled no | | scalapack yes | | Elpa no | | FFTW yes | | libvdwxc yes | | PAW-datasets (1) /apps/virtenv/gpaw22.1.0/paw-datasets/gpaw-setups-0.9.20000/ | ------------------------------------------------------------------------------------------------------------- |
Primjer skripte za opis posla:
Code Block | ||
---|---|---|
| ||
#$ -N gpaw-parallel #$ -q p28.q #$ -pe *mpi 14 #$ -cwd module load GPAW/22.1.0 mpirun --mca btl_openib_allow_ib true -hostfile $TMPDIR/machines -np $NSLOTS gpaw python Ag3Au_test_srce.py | ||
Warning | ||
U izradi |
Instalacija
Programski paket GPAW je pripremljen s kompajlerom Intel 2019, Intel MKL Scalapack i MPI implementacijom OpenMPI 4.1 u Conda okruženju s Python 3.8. Instalacija je obavljena pripremom pomoćnih biblioteka na koje se paket oslanja, dopremanjem izvornog koda, učitavanjem potrebnih modula za kompajler i MPI paralelizaciju te izgradnjom Python wheel paketa koji se onda instalira u Conda okruženje.
...