...

U slučaju da neki od dijelova zahtjeva više memorije, program je moguće pokrenuti na ScaleMP vSMP čvoru.

Korištenje CENSO programa

CENSO se oslanja na druge zasebne programe (XTB,ORCA) te je prilagođena verzija enso programa. Na klasteru je pripremljen modul za korištenje CENSO/1.2.0 programa i vezan je uz  XTB 6.4.1, CREST 2.11.1 i ORCA 5.0.2. S obzirom na prirodu programa nije moguće širenje van pojedinih čvorova te je obavezno korištenje mpisingle paralelne okoline.

Konfiguracijska datoteka .censorc nalazi se u direktoriju /apps/censo/ te je jedinstvena za sve korisnike i nije je potrebno konfigurirati za svakog korisnika. Sve opcije dostupne su kroz komandnu liniju pri opisivanju posla. Zbog ovakve konfiguracije pri pozivanju posla nužna je zastavica
-inprc /apps/censo/.censorc

Program se postavlja u korisnikovu okolinu koristeći naredbu module load censo/1.2.0

#$ -N censo_test
#$ -cwd
#$ -pe p28-mpisingle 14
module load censo/1.2.0
censo -inp VAŠI_ULAZNI_PODACI -O 7 -P 2 -inprc /apps/censo/.censorc

U primjeru su korištene zastavice -O i -P kako bi se raspodijeli posao pri čemu zastavica -P govori koliko paralelnih procesa se izvodi (u primjeru 2) i koliko svaki od njih koristi jezgara (7). Bitno je da umnožak -O i -P NE PRELAZI ukupan broj traženih jezgara.
Više o korištenju censo programa možete pročitati na web stranicama paketa.

Korištenje XTB paketa na ScaleMP vSMP čvoru

...