Versions Compared

Key

  • This line was added.
  • This line was removed.
  • Formatting was changed.
Comment: update & memory benchmark

...

Testiranje se radilo ovisno o:

  1. broju zatraženih jezgri
  2. ograničavanju količine memorije koju cp2k koristi

U slučaju promjene broja jezgara, testiranje se odvijalo u konfiguracijama:

  • predložak: svi
  • verzija: 8.2.0
  • redovi: a16, p28
  • paralelne okoline: *mpi, *mpisingle
  • broj jezgara: 1 - 256

U slučaju ograničavanja količine memorije, testiranje se odvijalo u konfiguracijama:


Note
titleBroj jezgri i vrijeme izvršavanja

U p28 redu, pri manjem broju jezgara (2 - 16) poslovi se prekidaju radi prekoračenja vremenskog ograničenja (7 dana) u nekim od predložaka (npr. H20-64-RI-MP2)


Warning
titleOgraničavanje memorije

Dobra praksa Nužno je ograničiti količinu memorije koju cp2k koristi, jer u protivnom može doći do:

  • prekoračenja dostupne memorije, koja uzrokuje prijevremeno zaustavljanje programa
  • usporavanja aplikacija ostalih korisnika na istom čvoru

Načini na koji se to može ostvariti:

  • definicijom traženog resursa u zaglavlju SGE skripte (pomoću parametra #$ -l memory=<količina GB po procesu>)
  • definicijom odgovarajućeg parametra u ulaznoj datoteci (npr. MAX_MEMORY u predlošcima H20-64-RI-MP2 i LiH-HFX)

H2O-64

Image Removed

Fayalite-FIST

Image Removed

...

Image Removed

H2O-DFT-LS

Image Removed

...

Ovisnost o broju jezgri

Gallery
columns5
includeLabelnslots

Ovisnost o količini dostupne memorije

Image Added

...

Image Removed