...
Code Block | ||
---|---|---|
| ||
#$ -N alphafold2 #$ -pe gpu 1 #$ -cwd module load bioinfo/alphafold2/2.0.1 GPUDEVICE=$(cat $TMPDIR/gpu) run_alphafold.sh -d $ALPHAFOLDDB -o dummy_test -m model_1 -f example/query.fasta -t 2020-05-10 -ga $GPUDEVICE |
Instalacija
Aplikacija je pripremljena koristeći miniforge
Conda installer slijedeći upute s: https://github.com/kalininalab/alphafold_non_docker
...