Korištenje
Na klasteru su instalirane varijante programskog paketa Gromacs u serijskoj i paralelnoj izvedbi za CPU (klasični procesori) i GPU (grafički procesori).
Dostupne verzije su:
Verzija | Implementacija | Modul | Napomena |
---|---|---|---|
5.1.4 | single precision multithread | gromacs/5.1.4 | Koristiti isključivo uz *mpisingle |
5.1.4 | double precision multithread | gromacs/5.1.4-double | Koristiti isključivo uz *mpisingle |
5.1.4 | single precision MPI | gromacs/5.1.4-mvapich22 | |
5.1.4 | double precision MPI | gromacs/5.1.4-mvapich22-double | |
2018.4 | single precision multithread | gromacs/2018.4 | Koristiti isključivo uz *mpisingle |
2018.4 | double precision multithread | gromacs/2018.4-double | Koristiti isključivo uz *mpisingle |
2018.4 | single precision MPI | gromacs/2018.4-mvapich22 | |
2018.4 | double precision MPI | gromacs/2018.4-mvapich22-double | |
2018.4 | single precision multithread + GPU | gromacs/2018.4-gpu | Koristiti isključivo uz gpusingle |
2018.4 | single precision MPI + GPU | gromacs/2018.4-mvapich2-gpu |
...