Dostupne verzije su:
| Verzija | Implementacija | Modul | Napomena |
|---|---|---|---|
| 5.1.4 | single precision multithread | gromacs/5.1.4 | Koristiti isključivo uz *mpisingle |
| 5.1.4 | double precision multithread | gromacs/5.1.4-double | Koristiti isključivo uz *mpisingle |
| 5.1.4 | single precision MPI | gromacs/5.1.4-mvapich22 | |
| 5.1.4 | double precision multithread | gromacs/5.1.4-mvapich22-double | |
| 2018.3 | gromacs/2018.3 |
Primjer korištenja multithread verzije:
| Code Block |
|---|
#$ -pe *mpisingle 8 module load gromacs/20185.1.4 mpirun_rshgmx mdrun -npnt $NSLOTS -hostfile $TMPDIR/machines mdrun ... -nice 0 -v -c conf30.gro -s topol30.tpr -px pullx30.xvg -pf pullf30.xvg -g md30.log -e ener30.edr -x traj30.xtc -cpi state.cpt -append |
| Warning |
|---|
OBAVEZNO koristiti uz mpisingle, te ne širiti proces na više od 16 jezgri |
...