...
HISAT2 je brz program za usklađivanje za mapiranje čitanja NGS (i DNK i RNK) na populaciju ljudskih genoma kao i na jedan referentni genom. Uz korištenje jednog globalnog GFM indeksa koji predstavlja populaciju ljudskih genoma, HISAT2 koristi veliki skup malih GFM indeksa koji zajedno pokrivaju cijeli genom. Ovi mali indeksi (koji se nazivaju lokalnim indeksima), u kombinaciji s nekoliko strategija poravnanja, omogućuju brzo i točno poravnanje čitanja sekvenciranja.
Dostupne verzije
Verzija | Modul | Supek | Padobran |
---|---|---|---|
2.2.1 | scientific/HISAT2/2.2.1 |
Službena dokumentacija
...