...
Dostupne baze za korištenje:
- nr
- nt
- swissprot
- kog
- pfam
- NR
- NT
- Swissprot
Varijabla za baze BLASTDB
Code Block | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
| ||||||
#!/bin/bash #PBS -N ncbi-ex #PBS -l ncpus=16 cd $PBS_O_WORKDIR module load scientific/NCBI-BLAST+/2.14.1 ncbi-blast+.sh blastp -query cow.1.protein.faa -db $BLASTDB/nr/nr -num_threads=$NCPUS -mt_mode=1 |
...