Table of Contents |
---|
Opis
Multiwfn je računalno-kemijska aplikacija za analizu elektronskih valnih funkcija.
Multiwfn je otvorenog koda, a posjeduje i mogućnost rada u GUI-ju (grafičkom korisničkom sučelju).
Službena dokumentacija
Verzije
Verzija | Modul | Kompajler | Podrška | Paralelizacija * | Supek | Padobran |
---|---|---|---|---|---|---|
3.8 | scientific/multiwfn/3.8 | GNU C kompajler, Intel Fortran kompajler | CPU | SMP |
Tip | ||||
---|---|---|---|---|
| ||||
Kod paralelizacije s dijeljenom memorijom (engl. Shared-Memory Parallelism, SMP) program je podijeljen na više threadova i svi imaju pristup istoj, tj. zajedničkoj (dijeljenoj) memoriji. To znači da se aplikacija mora izvršavati na jednom radnom čvoru. |
Izvršne datoteke
Multiwfn | Multiwfn_noGUI |
---|
Napomena
Tip | ||
---|---|---|
| ||
Kako bi se aplikacija uspješno pokrenula uz korištenje grafičkog sučelja, potrebno je spojiti se na pristupni čvor uz prosljeđivanje X11. U slučaju korištenja Linuxa ili macOS-a, koristite naredbu:
U slučaju korištenja Windowsa, potrebno je preuzeti aplikaciju Xming te je pokrenuti prije pokretanja PuTTY-ja. Unutar PuTTY-ja, potrebno je uključiti X11 forwarding (Connection → SSH → X11, Enable X11 forwarding). |
Primjer korištenja
- Za interaktivno pokretanje uz GUI, prvo je potrebno pokrenuti interaktivan posao, uz prosljeđivanje X:
Code Block | ||||
---|---|---|---|---|
| ||||
$ qsub -I -X -q cpu -l select=1:ncpus=16:mem=32gb |
- Po pokretanju interaktivno posla, smjestit ćete se u home direktorij. Navigirajte do direktorija u kojem se nalaze Vaša input datoteka, npr.:
Code Block | ||||
---|---|---|---|---|
| ||||
$ cd multiwfn/ |
- Učitajte modul, a zatim pokrenite aplikaciju.
- Broj traženih jezgri, odnosno argument
-nt
opcije aplikacije preuzet će se iz Vaše okoline, tj. izncpus
opcije. OMP_STACKSIZE
varijabla automatski će se postaviti po formuli(0.75*mem)/ncpus
- Broj traženih jezgri, odnosno argument
Code Block | ||||
---|---|---|---|---|
| ||||
$ module load scientific/multiwfn/3.8 $ Multiwfn H2O_m3ub3lyp.wfn |
- U promptu odaberite željene opcije: