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| Code Block | ||||||
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#!/bin/bash
#PBS -N STAR-ex
#PBS -l select=1:ncpus=32:mem=10GB
#PBS -j oe
cd $PBS_O_WORKDIR
module load scientific/STAR/2.7.11a
STAR --runThreadN $NCPUS --runMode genomeGenerate --genomeDir index --genomeFastaFiles GCF_000001735.4_TAIR10.1_genomic.fna --sjdbGTFfile genomic.gff --sjdbOverhang 149
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