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Code Block | ||||
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#PBS -N alphapulldown-MSA #PBS -q cpu #PBS -l select=1:ncpus=8:mem=40GB cd $PBS_O_WORKDIR module load scientific/alphapulldown/0.30.7 apptaineralphapulldown.sh create_individual_features.py --fasta_paths=baits.fasta,example_1_sequences_shorter.fasta --data_dir=$ALPHADB --save_msa_files=False --output_dir=out --use_precomputed_msas=False --max_template_date=2023-11-11 --skip_existing=False |
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