...
Konfiguracijska skripta:
| Code Block | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| ||||||
alignment_choice: diamond subroutine: all database: mmetsp mets_or_mags: mags nucleotide_extension: .fna original_tax_table: taxonomy-table.txt original_taxonomy: taxonomy-table.txt output: out protein_extension: .faa protein_map: prot-map.json ref_fasta: reference.pep.fa reference: ref_dir samples: sample_MAGs CPUs: 2$NSLOTS no_busco: 1 |
| Info |
|---|
Korištenje EUKulele iskljičivo sa skriptom, komanda linija ne prenosi argumente za CPU pravilno. Busco verzija je nekompatibilna sa radom 2.0.6 EUKulele stoga se koristi no_busco: 1 argument. Odabrana baza će se automatski skinuti ako ne postoji u lokalno direktorij, stoga nakon korištenja se treba obrisati zbog veće količine podataka. |
...