| Table of Contents |
|---|
...
ORCA je računalno-kemijska aplikacija općenitog tipa koji nudi širok raspon metoda i može se smatrati besplatnom alternativom za komercijalni GAUSSIAN.
ORCA je aplikacija zatvorenog koda i dolazi s Open MPI implementacijom MPI-ja.
Verzije
| verzija | modul | paralelizacija |
|---|---|---|
| 5.0.4 | scientific/orca/5.0.4 | MPI * |
| Warning | ||
|---|---|---|
| ||
ORCA dolazi u obliku predkompajliranih prekompajliranih izvršnih datoteka koje se povezuju na Open MPI knjižnice verzije 4.1.1, a koje trenutno nisu kompatibilne sa Supekovim interkonekcijskim sustavom, odnosno HPE Cray Slingshot mrežom. Iz tog razloga, ORCA-u je u trenutnoj iteraciji nužno koristiti unutar jednog radnog čvora, po uzoru na OpenMP aplikacije. |
...
- https://www.orcasoftware.de/tutorials_orca/#
- https://orcaforum.kofo.mpg.de/app.php/portal
- ORCA 5.0.4 priručnik
Primjeri
Za uspješno izvršenje pravilno pokretanje aplikacije morate zatražiti jedan računalni čvor.
U primjeru niže, aplikacija će se pokrenuti s sa 16 MPI procesa.
| Warning |
|---|
Postavke ORCA simulacije, koje uključuju i broj procesorskih jezgri te radne memorije, definiraju se u ulaznoj ORCA Budući da aplikacija ne komunicira direktno s PBS sustavom, važno je osigurati da količina resursa u .inp toj datoteci odgovara količini zatrežnih zatraženih resursa u zaglavlju PBS skripte kako ne bi došlo do diskrepancije. |
Broj procesorskih jezgri u ulaznu datoteku možete unijeti ručno.
Niže je jednostavan primjer PBS skripte koja će modificirati vašu input skriptu ulaznu datoteku (pod pretpostavkom da u istu već niste unijeli %PAL liniju za paralelno izvođenje).
...