...
Verzije
| Verzija | Modul |
|---|---|
| 4.4.0.0 | scientific/gatk4/4.4.0.0 |
Službena dokumentacija
...
| Code Block | ||||
|---|---|---|---|---|
| ||||
#!/bin/bash
#PBS -N gatk4-HTcaller
#PBS -q cpu
#PBS -l select=1:ncpus=2:mem=10GB
cd $PBS_O_WORKDIR
module load scientific/gatk4/4.4.0.0
gatk --java-options "-Xmx8G" HaplotypeCaller -R reference.fasta -I input.bam -O output.vcf |
...