MultiQC je alat za izvješćivanje koji analizira rezultate i statistiku iz izlaza bioinformatičkih alata, kao što su datoteke dnevnika i izlazi konzole. Pomaže u sažimanju eksperimenata koji sadrže više uzoraka i više koraka analize. Dizajniran je za postavljanje na kraj cjevovoda ili za ručno pokretanje kada završite s pokretanjem svojih alata.