Opis:

SRA Toolkit i SDK iz NCBI-ja su zbirka alata i biblioteka za korištenje podataka u arhivama INSDC Sequence Read.


Verzije:

VerzijaModulSupekPadobran
3.0.10scientific/sra-tools/3.0.10(error) (tick)

Službena dokumentacija:


Primjeri:

split.pbs
#PBS -N split
#PBS -q cpu
#PBS -l select=1:ncpus=10:mem=40GB
 
cd $PBS_O_WORKDIR
 
module load scientific/sra-tools/3.0.5
 
fasterq-dump --split-files SRR7733443 --threads $NCPUS