Opis

Avogadro je računalno-kemijska aplikacija za vizualizaciju molekula.

Verzije

VerzijaModulPodrškaSupekPadobran
1.2.0scientific/avogadro/1.2.0CPUcheck mark button check mark button 

Napomene

Avogadro je potrebno koristiti isključivo za vizualizaciju.

Kako bi se aplikacija uspješno pokrenula, potrebno je spojiti se na pristupni čvor uz prosljeđivanje X11.

U slučaju korištenja Linuxa ili macOS-a, koristite naredbu:

ssh -X -i ~/.ssh/id_rsa username@login-cpu.hpc.srce.hr

U slučaju korištenja Windowsa, potrebno je preuzeti aplikaciju Xming te je pokrenuti prije pokretanja PuTTY-ja.

Unutar PuTTY-ja, potrebno je uključiti X11 forwarding (Connection → SSH → X11, Enable X11 forwarding).

Primjer korištenja

Učitajte modul:

$ module load scientific/avogadro/1.2.0

Pokrenite aplikaciju, odnosno otvorite željenu strukturu:

$ avogadro C2H4BrCl.xyz