Svaki korisnik lokalno istalira R pakete.
Upute za instalaciju paketa:
Pokrenite R
R
Instalacije glavnog paketa:
Sys.setenv(R_INSTALL_STAGED = FALSE)
if (!requireNamespace("BiocManager", quietly = TRUE))
install.packages("BiocManager")
BiocManager::install()
Instalaciju dodatnih bioconductor paketa (npr. GenomicFeatures):
Sys.setenv(R_INSTALL_STAGED = FALSE)
BiocManager::install("GenomicFeatures")
Pokretanje aplikacije:
bioconductor.sge
#!/bin/bash #$ -N test #$ -cwd Rscript imeSkripte.R
qsub bioconductor.sge