Opis

Clustal Omega je program za višestruko poravnavanje sekvenci za poravnavanje tri ili više sekvenci zajedno na računalno učinkovit i točan način.

Proizvodi biološki značajna višestruka poravnanja sekvenci divergentnih sekvenci. Evolucijski odnosi mogu se vidjeti gledanjem kladograma ili filograma.

Verzije

VerzijaModulSupekPadobran
1.2.4scientific/clustalO/1.2.4(error) (tick)

Službena dokumentacija

Primjer

Align
#!/bin/bash
#PBS -N ClustalO-test
#PBS -l select=1:ncpus=40:mem=10GB

cd $PBS_O_WORKDIR

module load scientific/clustalO/1.2.4
 
clustalo -i bench/tms_test-only.vie -o tms_test-only.a2m -v --threads $NCPUS

Napomena

Program Clustal Omega zadano uzima sve dostupne procesore, stoga je potrebno ograničit sa opcijom --thread pri korištenju.

  • No labels