Svaki korisnik lokalno istalira R pakete:
Upute za instalaciju paketa:
Pokrenite R
R |
Instalacije glavnog paketa:
Sys.setenv(R_INSTALL_STAGED = FALSE)
if (!requireNamespace("BiocManager", quietly = TRUE))
install.packages("BiocManager")
BiocManager::install() |
Instalaciju dodatnih bioconductor paketa (npr. GenomicFeatures):
Sys.setenv(R_INSTALL_STAGED = FALSE)
BiocManager::install("GenomicFeatures") |
Pokretanje aplikacije:
#!/bin/bash #$ -N test #$ -cwd Rscript imeSkripte.R |
qsub bioconductor.sge |