https://www.bioconductor.org/

Svaki korisnik lokalno istalira R pakete:


Upute za instalaciju paketa:

Pokrenite R

R

Instalacije glavnog paketa:

Sys.setenv(R_INSTALL_STAGED = FALSE)
if (!requireNamespace("BiocManager", quietly = TRUE))
    install.packages("BiocManager")
BiocManager::install()

Instalaciju dodatnih bioconductor paketa (npr. GenomicFeatures):

Sys.setenv(R_INSTALL_STAGED = FALSE)
BiocManager::install("GenomicFeatures")


Pokretanje aplikacije:


#!/bin/bash
#$ -N test
#$ -cwd

Rscript imeSkripte.R


qsub bioconductor.sge