Verzija | Modul |
---|---|
3.8.1 | WRF/3.8.1-openmpi-intel |
4.1.5 | WRF/4.1.5 |
4.3 | WRF/4.3 |
Sve verzije su optimirane za izvođenje na p28* redovima |
U najosnovnijoj verziji, tijek rada pri izradi simulacija je sljedeći:
Prvi korak je serijske prirode i ne zahtijeva pozivanje neke od dostupnih paralelnih okolina.
Drugi se korak većinski oslanja na paralelizaciju i ubrzanje proračuna korištenjem više procesora.
Dva savjeta za lakše izvođenje simulacija:
|
Ispod se nalaze upute za korištenje verzije WRF 4.3 temeljene na službenom predlošku WRF-ARW (uragan Matthew)
Datoteke koje su predstavljene izvršiti će spomenuti predložak u trenutnom direktoriju:
Upute o podnošenju poslova bi trebale biti primjenjive i na prijašnje verzije WRF, no postoji mogućnost da se ulazne datoteke moraju prilagoditi (detaljnije upute na službenim stranicama) |
&share wrf_core = 'ARW' max_dom = 1 start_date = '2016-10-06_00:00:00' end_date = '2016-10-08_00:00:00' interval_seconds = 21600 io_form_geogrid = 2 active_grid = .true. / &geogrid parent_id = 1 parent_grid_ratio = 1 i_parent_start = 1 j_parent_start = 1 e_we = 91 e_sn = 100 geog_data_res = 'default' dx = 27000 dy = 27000 map_proj = 'mercator' ref_lat = 28.00 ref_lon = -75.00 truelat1 = 30.0 truelat2 = 60.0 stand_lon = -75.0 geog_data_path = opt_geogrid_tbl_path = / &ungrib out_format = 'WPS' prefix = 'FILE' / &metgrid fg_name = 'FILE' io_form_metgrid = 2 opt_metgrid_tbl_path = / |
&time_control run_days = 0 run_hours = 48 run_minutes = 0 run_seconds = 0 start_year = 2016 start_month = 10 start_day = 06 start_hour = 00 end_year = 2016 end_month = 10 end_day = 08 end_hour = 00 interval_seconds = 21600 input_from_file = .true. history_interval = 180 frames_per_outfile = 1 restart = .false. restart_interval = 1440 io_form_history = 2 io_form_restart = 2 io_form_input = 2 io_form_boundary = 2 debug_level = 0 / &domains time_step = 100 max_dom = 1 e_we = 91 e_sn = 100 e_vert = 45 p_top_requested = 5000 num_metgrid_levels = 32 num_metgrid_soil_levels = 4 dx = 27000 dy = 27000 grid_id = 1 parent_id = 0 i_parent_start = 1 j_parent_start = 1 parent_grid_ratio = 1 feedback = 1 smooth_option = 0 / &physics mp_physics = 3 ra_lw_physics = 1 ra_sw_physics = 1 radt = 30 sf_sfclay_physics = 1 sf_surface_physics = 2 num_soil_layers = 4 bl_pbl_physics = 1 bldt = 0 cu_physics = 1 cudt = 5 isfflx = 1 ifsnow = 1 icloud = 1 surface_input_source = 3 num_land_cat = 21 sf_urban_physics = 0 sf_ocean_physics = 0 / &dynamics w_damping = 0 diff_opt = 1 km_opt = 4 diff_6th_opt = 0 diff_6th_factor = 0.12 base_temp = 290. damp_opt = 0 zdamp = 5000. dampcoef = 0.2 damp_opt = 0 damp_opt = 0 non_hydrostatic = .true. moist_adv_opt = 1 scalar_adv_opt = 1 / &bdy_control spec_bdy_width = 5 spec_zone = 1 relax_zone = 4 specified = .true. nested = .false. / &namelist_quilt nio_tasks_per_group = 0 / |
#$ -N wps #$ -cwd # postavi okolinu module load WRF/4.3 # skini ulazne podatke i spremi ih u direktorij DATA wget -N https://www2.mmm.ucar.edu/wrf/TUTORIAL_DATA/matthew_1deg.tar.gz mkdir -p DATA tar xvf matthew_1deg.tar.gz -C DATA --strip-components 1 --skip-old-files # upiši pravilne staze u namelist.wps GEOGPATH="'/apps/WRF/WPS_GEOG'" GTBLPATH="'${WRF_HOME}/WPS/geogrid'" MTBLPATH="'${WRF_HOME}/WPS/metgrid'" sed -i "s| geog_data_path.*| geog_data_path = ${GEOGPATH}|g" namelist.wps sed -i "s| opt_geogrid_tbl_path.*| opt_geogrid_tbl_path = ${GTBLPATH}|g" namelist.wps sed -i "s| opt_metgrid_tbl_path.*| opt_metgrid_tbl_path = ${MTBLPATH}|g" namelist.wps # wps koraci link_grib.csh DATA/fnl VTBLPATH="${WRF_HOME}/WPS/ungrib/Variable_Tables/Vtable.GFS" ln -sf $VTBLPATH Vtable ungrib.exe geogrid.exe metgrid.exe |
#$ -N wrf-serial #$ -cwd # postavi okolinu module load WRF/4.3 # stavi poveznice na dodatne datoteke iz direktorija WRF/run ( osim namelist.input* ) find $WRF_HOME/WRF/run -type f ! -name 'namelist.input*' -exec ln -s {} . \; # wrf real korak real.exe |
#$ -N wrf-parallel #$ -cwd #$ -pe p28-mpi 4 # postavi okolinu module load WRF/4.3 # wrf wrf korak mpirun -np $NSLOTS wrf.exe |
#!/bin/bash # podnesi SGE skripte jednu za drugom qsub -N wps wps.sge qsub -hold_jid wps -N wrf-serial wrf-serial.sge qsub -hold_jid wrf-serial -N wrf-parallel wrf-parallel.sge |
Ispod se nalazi totalno vrijeme integracije kao i paralelna efikasnost izvršenja gore opisanog predloška
Paralelna efikasnost veća od jedan je do serijskog izvođenja na a16* redu (samo jedan procesor) za koji WRF nije optimizran |