Ustrojstvena jedinica je prozor koji sadrži osnovne podatke o ustrojstvenim jedinicama u sustavu ISVU: sveučilištima, visokim učilištima, visokim školama, veleučilištima, fakultetima…
Važno je unijeti podatke u ovaj prozor jer će se kasnije, prilikom evidencije predmeta koji se izvode na visokom učilištu, za svaki predmet moći evidentirati kojoj ustrojstvenoj jedinici pripada: zavodu, katedri, odjelu ili sl.
Predmeti koji su pridodani istoj ustrojstvenoj jedinici mogu se kasnije, kod izrade rasporeda za ispite, staviti u istu ispitnu grupu. Predmete unutar iste ustrojstvene jedinice može se analizirati po raznim kriterijima: prolaznosti, ocjenama, broju studenata itd.
Prozor Ustrojstvena jedinica otvara se odabirom izbornika Ustanova, a zatim odabirom opcije Ustrojstvena jedinica.
Organizacijske jedinice koje korisnik može vidjeti su:

• organizacijska jedinica na kojoj je korisnik zaposlen (temeljna ustanova korisnika)
• organizacijske jedinice podređene organizacijskoj jedinici na kojoj je evidentirano korisnikovo zaposlenje (npr. Zavodi, katedre, odsjeci)
• nadređena organizacijska jedinica (npr. Sveučilište u Splitu)
• sva ostala visoka učilišta, ali ne može vidjeti organizacijsku strukturu drugog visokog učilišta
• sve ostale zapise u prozoru Ustrojstvena jedinica

Korisnik može mijenjati, unositi i brisati sve podređene organizacijske jedince, ali ne može mijenjati podatke o svom visokom učilištu, drugim visokom učilištu, nadređenoj ustrojstvenoj jedinci, te mjestu rada.