RAxML (Randomized Axelerated Maximum Likelihood) je program za sekvencijalne i paralelne Zaključivanje velikih filogenetskih stabala temeljeno na maksimalnoj vjerojatnosti. Također se može koristiti za post- analize skupova filogenetskih stabala, analize poravnanja i evolucijskog postavljanja kratkih očitanja. Izvorno je izveden iz fastDNAml koji je pak izveden iz Joea Felsenteina dnaml koji je dio PHYLIP paketa. |
Verzija | Modul | Supek | Padobran |
---|---|---|---|
8.2.13 | scientific/raxml/8.2.13 |
#!/bin/bash #PBS -N raxml-test #PBS -l select=1:ncpus=12 #PBS -q cpu cd $PBS_O_WORKDIR module load scientific/raxml/8.2.13 raxml.sh raxmlHPC -PTHREADS-SSE3 -T $NCPUS -m BINGAMMA -p 12345 -s binary.phy -n T1 |