cdo je skup komandno linijskih naredbi za analizu i upravljanje izlazima klimatskim i numeričkim modelima za prognozu vremena. Podržani formati podataka su GRIB 1/2, netCDF 3/4, SERVICE, EXTRA i IEG.
Verzija | Modul | apptainer | Linux OS | Supek | Padobran |
---|---|---|---|---|---|
2.0.4 | scientific/cdo | Ubuntu 22.04 |
Za nezahtjevne operacije može se izvoditi na pristupnom čvoru, za zahtjevnije i dulje operacije potrebno je podnositi posao za radne čvorove.
module load scientific/cdo # preuzimanje pokazne netCDF datoteke wget https://www.unidata.ucar.edu/software/netcdf/examples/ECMWF_ERA-40_subset.nc cdo -infon ECMWF_ERA-40_subset.nc cdo --operators |
Kod nekih operatora moguće je koristiti OpenMP paralelizaciju. Popis operatora nalazi se na poveznici https://code.mpimet.mpg.de/projects/cdo/wiki/OpenMP_support
#PBS -q cpu #PBS -l select=1:ncpus=8:mem=4GB cd ${PBS_O_WORKDIR} module load scientific/cdo cdo -P 8 -b F64 detrend ECMWF_ERA-40_subset.nc detrend.nc |