FastQC ima za cilj pružiti jednostavan način za obavljanje nekih provjera kontrole kvalitete neobrađenih podataka slijeda koji dolaze iz cjevovoda sekvenciranja visoke propusnosti.
Pruža modularni skup analiza koje možete upotrijebiti da brzo steknete dojam o tome imaju li vaši podaci problema kojih biste trebali biti svjesni prije bilo kakve daljnje analize.
Glavne funkcije FastQC-a su:
Verzija | Modul | Supek | Padobran |
---|---|---|---|
0.12.1 | scientific/FastQC/0.12.1 |
#!/bin/bash #PBS -N fastqc-ex #PBS -l ncpus=8 cd $PBS_O_WORKDIR module load scientific/FastQC/0.12.1 fastqc.sh fastqc -t $NCPUS example.fastq |