Gaussian je komercijalna računalno-kemijska aplikacija općenitog tipa, širokog spektra primjena, s nizom metoda za kvantno-mehaničko modeliranje.
Može koristiti za modeliranje molekularne strukture, dinamike, optičkih i spektroskopskih svojstava molekula, kao i za predviđanje kemijskih reakcija.
Gaussian je dostupan isključivo zaposlenicima i suradnicima Sveučilišta u Zagrebu. |
Gaussian prilikom paralelizacije radi s dijeljenom memorijom, odnosno nema mogućnost širenja van jednog računalnog čvora. |
Verzija | Modul | Supek | Padobran |
---|---|---|---|
16 (rev. C01) | scientific/gaussian/16-C01 |
U primjeru niže, aplikacija će se pokrenuti na 8 procesorskih jezgri.
Aplikacija se pokreće pomoću |
#PBS -q cpu #PBS -l select=1:ncpus=8:mem=2gb cd ${PBS_O_WORKDIR} module load scientific/gaussian/16-C01 dog input.com |
dog.mem
dog.mem
je proširena dog
skripta koja automatski ukomponira korištenje %Mem
opcije, odnosno interne Gaussianove varijable GAUSS_MDEF
.
Konkretno, od ukupno zatražene memorije u zaglavlju PBS skripte, Gaussian će se ograničiti na alociranje 75 % zatraženog iznosa. Tako će za zatraženih 32 GiB, Gaussian ograničiti na alociranje 25770 MB.
#PBS -q cpu #PBS -l select=1:ncpus=16:mem=32gb cd ${PBS_O_WORKDIR} module load scientific/gaussian/16-C01 dog.mem input.com |
G16 is running on 16 CPU cores, allocating a maximum memory (RAM) of 25770 MB. Input-file: input.com |