Page History

...

$SGE_O_HOST : adresa računala sa kojeg je pokrenut posao
$SGE_O_PATH : originalna vrijednost varijable okoline PATH prilikom pokretanja posla
$SGE_O_WORKDIR : direktorij iz kojeg je posao pokrenut
$SGE_STDOUT_PATH : datoteka u koju se sprema standardni izlaz
$SGE_STDERR_PATH : datoteka u koju se sprema standardna greška
$HOSTNAME : adresa računala na kojem se izvršava skripta
$JOB_ID : SGE identifikator posla
$JOB_NAME : ime posla
$PE_HOSTFILE : ime datoteke u kojoj su navedene adrese računala
$QUEUE : ime reda u kojem se posao izvršava
$SGE_TASK_ID : identifikator zadatka kod polja poslova
$TMPDIR : ime direktorija u koji se mogu spremati privremene datoteke (/scratch).

Gdje spremati privremene podatke i rezultate?

Za spremanje privremenih podataka i rezultat ne preporuča se korištenje $HOME direktorija, budući da se time smanjuje učinkovitost aplikacije te se opterećuju frontend i mreža klastera. Za ovakve datoteke uputno je koristiti varijablu $TMPDIR koja će za svaki pojedini posao kreirati direktorij na radnim čvorovima oblika /scratch/<jobID>.<taskID>.<queue> koji će se automatsko ukloniti nakon završetka posla. Ukoliko postoje naznake da će kreirane privremene datoteke premašiti vrijednost od 500Gb, spremanje privremenih podataka treba se vršiti na disk /shared.

Primjer korištenja automatski kreiranog direktorija pomoću varijable $TMPDIR:

#$ -N scratch
#$ -cwd
#$ -o output/scratch.out
#$ -j y

cd $TMPDIR
pwd > test
cp test $SGE_O_WORKDIR

Korištenje diska /shared kada aplikacija barata privremenim podatcima većim od 500Gb:

#$ -N scratch
#$ -cwd
#$ -o output/scratch.out
#$ -j y

mkdir -p /shared/$USER/$TMPDIR
cd /shared/$USER/$TMPDIR
pwd > test
sleep 120
cp test $SGE_O_WORKDIR

Praćenje i upravljanje izvođenjem poslova

...