Page History

...

Ako neki od parametara nisu definirani koristiti će se defaultne vrijednost:

Kontrola memorije pomoću cgrupa

...

#!/bin/bash

#PBS -q cpu
#PBS -l walltime=10:00:00
#PBS -l select=16

module load mpi/openmpi-x86_64

cd ${PBS_O_WORKDIR}

mpiexec pw.x -i calcite.in

MPI + OpenMP (hibridna) paralelizacija

Ako se Vaša aplikacije može paralelizirati hibridno, odnosno dijeliti svoje MPI procese u OpenMP threadove, možete posao pozvati na način kako je prikazano u primjeru GROMACS aplikacije niže:

#!/bin/bash

#PBS -q cpu
#PBS -l walltime=10:00:00
#PBS -l select=8:ncpus=4:mem=14GB

module load mpi/openmpi-x86_64

cd ${PBS_O_WORKDIR}

mpiexec -d ${OMP_NUM_THREADS} --cpu-bind depth gmx mdrun -v -deffnm md

Praćenje i upravljanje izvođenja posla

...

Izvršavanjem naredbe qstat bez dodatnih opcija dobiva se ispis svih trenuthi trenutnih poslova svih korisnika:

Job id            Name             User              Time Use S Queue
----------------  ---------------- ----------------  -------- - -----
111.admin         mpi+omp_s        kmrkalj           00:36:09 R cpu             

...

• after* - pokretanje trenutnog s obzirom na ostale
  
  • after - izvršavanje trenutnog nakon početka izvršavanja navedenih
  • afterok - izvršavanje trenutnog nakon uspješnog završetka navedenih
    
  • afternotok -izvršavanje trenutnognakon greške u završetku navedenih
    
  • afterany - izvršavanje trenutnog nakon završetka navedenih
• before* - pokretanje ostalih s obzirom na trenutni
  • before - pokretanjenavedenih nakon početka trenutnog
    
  • beforeok - pokretanjenavedenih nakon usprešnog uspješnog završetka trenutnog
    
  • beforenotok - pokretanjenavedenih nakon greške u izvršavanju trenutnog
  • beforeany - pokretanjenavedenih nakon završetka trenutnog
• on:<broj> - izvršavanje posla koji će ovisiti o naknadno navedenom broju before*   tipa poslova

...