...

# broj direktorija
marko@pc-mkvakic 15:05 ~[korisnik@kompjuter:] $ find ~/.local/lib/python3.9/site-packages /usr/local/lib/python3.9/dist-packages -type d | wc -l
4338

# broj datoteka
marko@pc-mkvakic 15:05 ~ [korisnik@kompjuter:] $ find ~/.local/lib/python3.9/site-packages /usr/local/lib/python3.9/dist-packages -type f | wc -l
47355

# veličine
marko@pc-mkvakic 15:06 ~ [korisnik@kompjuter:] $ du -hcs ~/.local/lib/python3.9/site-packages /usr/local/lib/python3.9/dist-packages 
939M	/home/marko/.local/lib/python3.9/site-packages
747M	/usr/local/lib/python3.9/dist-packages
1.7G	total

Apptainer i

...

python

Anchor
kontejner kontejner

Jedan od sve ustaljenijih načina dopremanja aplikacija na HPC klastere su apptainer i singularity; sučelja za stvaranje izoliranih razvojnih okolina zvanih Jedan od sve ustaljenijih načina dopremanja aplikacija na HPC klastere su apptainer i singularity; sučelja za stvaranje izoliranih razvojnih okolina zvanih kontejneri.

Kontejneri su datoteke koje u sebi sadrže aplikacije i njihove ovisnosti potrebne za izvršavanje na Unix operativnim sustavima u formi slike (engl. image) koja se stvara na osobnom računalu i, jednom kada se pripremi, doprema na superračunalo i koristi kao bilo koja druga aplikacija.

Upravo zbog činjenice da image sadrži sve ovisnosti i strukturu direktorija unutar samo jedne datoteke je ovaj način najpoželjniji za rad na Lustreu.

Ispod se nalaze upute za razvoj osnovnog python data Ispod se nalaze upute za razvoj osnovnog python data stacka koji se sastoji od knjižnica:

...

Bootstrap: docker
From: condaforge/miniforge3

%post

  conda create -n data_stack python=3.10 -y
  . /opt/conda/bin/activate
  conda activate data_stack
  pip3 install numpy scipy pandas matplotlib ipython

%environment

   export PS1='(data_stack) Apptainer> '
  export PATH='. /opt/conda/envs/data_stack/bin:/opt/conda/condabin:/opt/conda/bin:/usr/local/sbin:/usr/local/bin:/usr/sbin:/  usr/bin:/sbin:/bin'
  export CONDA_PREFIX='/opt/conda/envs/data_stack'
  export CONDA_SHLVL='1'
  export CONDA_DEFAULT_ENV='data_stack'
  export CONDA_PROMPT_MODIFIER='(data_stack) '
  export CONDA_EXE='/opt/conda/bin/conda'
  export _CE_M=''
  export _CE_CONDA=''
  export CONDA_PYTHON_EXE='/opt/conda/bin/python'bin/activate
  conda activate data_stack

%runscript

  exec python3 $@ 

...